Le 11 avril 2006, le ministre délégué à l'enseignement supérieur et à la recherche a attribué au CSTB le label Carnot pour l'ensemble de ses activités de Recherche et de Consultance. Le label Carnot est destiné à favoriser la recherche partenariale, en d'autres termes, la conduite de travaux de recherche publique en partenariat avec des acteurs socioéconomiques (industriels, entreprises, collectivités territoriales...). Le label Carnot est attribué pour quatre ans - renouvelables - à des organismes de recherche publique qui mènent simultanément des activités de recherche amont - propres à renouveler leurs compétences scientifiques et technologiques - et une politique volontariste en matière de recherche partenariale au profit du monde socioéconomique.

Grâce à un fort ancrage avec les acteurs socioéconomiques et une pratique s'appuyant sur son expérience d'assembleur et d'acteur de l'innovation, le CSTB est assembleur de R&D et "passeur d'innovation".